İrfan Aydın, 1987 yılında Bandırma Lisesi'nden mezun oldu. Ardından tıp eğitimine başlayarak 1995 yılına kadar Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde öğrenim gördü. Uzmanlık eğitimini ise 1995-2001 yılları arasında İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi'nde Plastik ve Rekonstrüktif Cerrahi alanında tamamladı.